Recorrido del museo Conjunto Histórico de San Juan del Hospital de Valencia
- Tránsito de entrada. S. XIII
- Cruces rojas del siglo XIII.
- Primitiva capilla del Tránsito. S. XIII
- Arcos en el patio del Vía-Crucis.
- Puerta románica de la primitiva iglesia de San Juan, siglo XIII.
- Escudo primitivo de la Orden de San Juan de Jerusalén, siglo XIII.
- Gradas del Circo romano de Valencia.
- Capilla de San Ferreol.
- Tramadas del antiguo atrio. Capilla de la Virgen de los Estudiantes, siglo XIV
- Imagen de Nuestra Señora la Virgen de los Estudiantes.
- Capilla del Calvario.
- Capilla de San Pedro. Retablo. S. XIV-XV
- Capilla de la Virgen María Madre de Dios
- Nave central y Presbiterio.
- Bandas sanjuanistas rojas y blancas, siglo XIII.
- Preside la Imagen de Nuestra Señora del Milagro:
- Imagen de San Juan Bautista, titular de la iglesia:
- Sillería del siglo XV
- Columnas del arco toral. Capiteles califales S. X.
- Losas sepulcrales, siglo XVII y XVIII.
- Primitiva capilla de Santa Bárbara. (Sur del presbiterio)
- Capilla de San Francisco de Asís. Acceso a la cámara oculta. (Norte del presbiterio)
- Capilla de San Miguel Arcángel o de las pinturas murales, siglo XIII.
- Real Capilla de Santa Bárbara. S. XVII
- Florón de la clave de la cúpula de la Real Capilla de Santa Bárbara.
- Retablo barroco de origen palentino.
- Esgrafiados barrocos.
- Capilla de la Pasión. Capilla de los Joan -Torres.
- Losa-escudo en mármol blanco de la familia Joan-Torres
- Capilla de San Josemaría Escrivá de Balaguer.
- Capillas penitenciales.
- La nueva capilla penitencial,
- La imagen de la Virgen de los Desamparados
- Patio sur. Cripta de Santa Bárbara.
- Cementerio medieval.
- Capilla hospitalario-funeraria o del rey Don Jaime, mitad del siglo XIII.
- Arco-solios del antiguo cementerio del Conjunto de San Juan del Hospital.